Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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