Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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