Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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