Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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