Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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