Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms