Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms