Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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SEMA3AQ14563 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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