Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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SPIDRQ14159 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SPIDRQ14159 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPIDRQ14159 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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