Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CBFBQ13951 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CBFBQ13951 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CBFBQ13951 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CBFBQ13951 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CBFBQ13951 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CBFBQ13951 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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