Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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