Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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