Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms