Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms