Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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ITGB3BPQ13352 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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ITGB3BPQ13352 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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ITGB3BPQ13352 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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ITGB3BPQ13352 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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ITGB3BPQ13352 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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ITGB3BPQ13352 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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ITGB3BPQ13352 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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ITGB3BPQ13352 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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ITGB3BPQ13352 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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ITGB3BPQ13352 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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ITGB3BPQ13352 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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