Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.92e-12■□□□□ 10.1
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PABPC4Q13310 PRKAR1A-202ENST00000392710 3551 ntTSL 27.86□□□□□ -1.153e-6■□□□□ 10.1
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PABPC4Q13310 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-9■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.26■■■□□ 2.592e-14■□□□□ 10.1
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PABPC4Q13310 GAS5-212ENST00000434796 575 ntTSL 23.48□□□□□ -1.856e-25■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.364e-16■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.254e-16■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.184e-16■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 ELOA-203ENST00000609199 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.254e-16■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.184e-7■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 FRYL-211ENST00000507873 7031 ntTSL 1 (best)5.82□□□□□ -1.484e-7■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.714e-7■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 FRYL-206ENST00000503339 3482 ntTSL 23.53□□□□□ -1.844e-7■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 ANAPC7-206ENST00000481473 1836 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.12e-7■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-7■□□□□ 10.1
PABPC4Q13310 RNF138-202ENST00000261593 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.464e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.384e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FEN1-202ENST00000535307 768 ntTSL 214.8□□□□□ -0.044e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPH3-208ENST00000481819 2704 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPH3-205ENST00000469172 3356 ntTSL 211.28□□□□□ -0.62e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SDHAF2-207ENST00000542794 1077 ntTSL 223.6■■□□□ 1.371e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 LMNA-204ENST00000368298 1475 ntTSL 1 (best)22.07■■□□□ 1.121e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.091e-11■□□□□ 10
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