Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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