Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NME3Q13232 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME3Q13232 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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