Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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