Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms