Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms