Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXF2Q12947 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXF2Q12947 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXF2Q12947 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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