Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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