Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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