Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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