Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms