Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms