Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms