Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNB3Q05901 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms