Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms