Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms