Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms