Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms