Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms