Protein–RNA interactions for Protein: P78527

PRKDC, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKDCP78527 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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PRKDCP78527 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PRKDCP78527 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRKDCP78527 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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