Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms