Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNA4P52798 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNA4P52798 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNA4P52798 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNA4P52798 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNA4P52798 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNA4P52798 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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EFNA4P52798 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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EFNA4P52798 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNA4P52798 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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