Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK8P49336 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms