Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms