Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms