Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms