Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms