Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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