Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms