Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms