Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms