Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCM3P25205 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCM3P25205 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCM3P25205 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCM3P25205 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCM3P25205 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms