Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALB2P22676 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALB2P22676 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALB2P22676 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALB2P22676 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALB2P22676 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALB2P22676 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALB2P22676 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALB2P22676 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALB2P22676 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALB2P22676 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALB2P22676 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALB2P22676 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms