Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD247P20963 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD247P20963 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD247P20963 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD247P20963 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD247P20963 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD247P20963 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CD247P20963 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms