Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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